Hola, no hay una opción concreta para dejar pagado un albarán. El campo de número de efectos además obliga a mínimo 1, con lo que al generar la factura, si tienes marcado para que te genere la cartera de forma automática, se te generará y pasará a estar pdte de pago.

Si es algo puntual, podrías hacer algo de este estilo (si es algo habitual, mejor mirad de hacer alguna adaptación). 

Por ejemplo (desde la parte de gestión): cuando generes la factura, no generes cartera, y le pasas el Rectif. de status - Compras Factura a cartera SÍ, para dejar la factura marcada como que sí ha generado cartera (sin generar el efecto, porque el rectif. no lo genera, solo marca la factura como que sí). 

Desde la parte de cartera, podrías hacer el proceso "normal" y cuando te generen el efecto, marcar dicho efecto modificador de campos como Borrado.

Si generas efecto, afecta al saldo de cartera. Si no lo generas, en cartera no repercute. 

Ahí ya depende de la necesidad del caso.

Saludos

Perfecto gracias